草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿装置最先见的妇科疾病之六。肾组织开展中CaOx晶胞过饱和状态磨合会引致肾小管神经细胞伤害和凋亡，而使引致肾结石的引起。短链多余脂肪的酸由肠内内厌氧反应器病毒堆肥膳食结构食物纤维引起，不光在身体局部肠内天然屏障中展现做用，且在装置情况上也展现关键所在做用。但其中，丁酸是最丰富的的短链多余脂肪的酸，兼备消除炎症和免疫力可以抑制做用,本探究讨论丁酸对CaOx肾结石的做用以至于存在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山诊所泌尿整形科吴忠硕士生导师、周子健医生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠专家教授、周子健博土在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了数据网络药剂学学售后服务，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

句子简称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 客人标准：华山医生 调查对象图片：大鼠、HK-2人体细胞 分成小组个人信息：差表组（Con）、绘图组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱带来技术性：互联网药剂学学查重

基本思路过程图

分析然而

设计人第一构造 大鼠3d整治，用生理学什么是生化招生指标和团队方面的问题学染色的等设计方法手段出现 丁酸可能降低CaOx3d整治大鼠肾CaOx晶胞的确立和断裂，改善效果CaOx3d整治大鼠的疾病断裂和阳极阳极氧化产品的过度紧张把你想表达出来。另外，丁酸还可能够抑制草酸诱导型的HK-2癌内部断裂、阳极阳极氧化应激反应和癌内部凋亡。 为探索丁酸构成和靶人类遗传遗传dna遗传互联网，理论研究成员从PubChem读取丁酸和丁酸酯的二维和三维图像构成（图1A）。按照PharmMapper网站统计动态数据系统库库和Uniprot网站统计动态数据系统库库加工后共筛分出1115个丁酸靶人类遗传遗传dna遗传供进几步探讨。将人类遗传遗传dna遗传文件列表引入STRING网站统计动态数据系统库库，开始PPI互联网探讨。Cytoscape提供了排名的前20的核心区靶人类遗传遗传dna遗传的详细的互联网图，涵盖CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这类核心区人类遗传遗传dna遗传与互联网中的其它的人类遗传遗传dna遗传均现象出一定的的关与的性，阐明这类人类遗传遗传dna遗传也许利用着联动效用。GO和KEGG探讨反映了丁酸核心区人类遗传遗传dna遗传的关与的路经和生物学工程学功能模块（图1C）。核心区人类遗传遗传dna遗传具体与类固醇皮质刺激反应素回应、防脱色应激状态状态回应、电化学活化氧体细胞对类固醇皮质刺激反应素刺激反应的反应及其对弱酸性电化学有害物质的反应关与。上面说明，这类核心区人类遗传遗传dna遗传具体参与者了防脱色应激状态状态和对电化学活化氧的生物学工程反应环节，是肾结石养成共识机制中意义重大的的路经，这阐明丁酸也许在肾结石中利用最重要的效用。

图1| 丁酸空间结构与靶什么是基因数据网络阐述(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进两步不断探索丁酸对CaOx肾结石事实上切靶表观遗传，深入剖析师回收利用GEO统计数据显示对GSE73680中键康相较比较与CaOx肾结石用户的表观遗传对比对其参与了深入剖析。相较比较组与CaOx结石用户的特殊性对比展示方式出表观遗传（DEGs）遗传遗传dna遗传检测的标准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共淘汰到3783个表观遗传会发生特殊发生改变，其中的3379个（89.4%）表观遗传展示方式出上浮，404个（10.6%）表观遗传展示方式出下跌（图2A）。对DEGs对其参与聚类分析法算法剖析，热图信息显示了前10个被选中DEGs的二维逐层聚类分析法算法特证（图2B）。然后，深入剖析师确认GeneCards统计数据显示人工正确处理亲子鉴定了370个机会与CaOx肾结石有关系联的表观遗传，综合排名前20位的预估表观遗传还有有关系联性评级图甲2C如图。从而寻到丁酸中药治疗CaOx肾结石的要素靶点，深入剖析师将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关系联表观遗传正确处理得出新一个Venn图。结果英文，CYP2C9被判定为丁酸影响力CaOx肾结石的内在靶点(图2D)。于此，深入剖析师还对其参与了丁酸与CYP2C9的原子核合作，CYP2C9的3个碳水化合物残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸互不功效，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在进行电脑网络药学学分析CYP2C9是丁酸反应CaOx肾结石的靶遗传基因后，的研究员工还能够 生殖细胞膜检测确认了CYP2C9可减小草酸促进的HK-2生殖细胞膜的ROS的水平、真菌感染损害和凋亡。

图2| 越多越据库联办解析預測CYP2C9是丁酸做用于CaOx肾结石的靶遗传基因

科学研究报告单

本学习先要发掘丁酸在身体外和身体里均能仰制CaOx肾结石模型工具的氧化物的应激反应状态和支原体感染损害，己经用网络信息数据药剂学学需求拥有丁酸损害CaOx肾结石的意向靶点——CYP2C9，最后一步用体细胞膜实验室确认CYP2C9在草酸盐诱骗的HK-2体细胞膜ROS标准、支原体感染损害和凋亡。这类发掘取决于丁酸可能会用仰制CYP2C9来仰制CaOx肾结石的氧化物的应激反应状态，消除支原体感染损害。这一项阶段中拜谱微动物带来了网络信息数据药剂学学技術贴心产品，因此拜谱微动物可提供成长加强制度建设的dna组学、膳食纤维质组学、细胞代谢组学等几组学车辆及技術贴心产品，欢迎会拨通服务咨询！ 参考价值论文资料：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.