代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
有效局部监定：代谢率率组学技能都可能对中药才茶中的物理化学工业有效局部做全面、明确定量分析，监定出名贵中药才材中的渗透性有效局部。举列，进行由于质谱（MS）的代谢率率组学技能，可能监定出冬虫夏草中的冬虫夏草皂苷等渗透性有效局部。在这种技能还可能判断入药价值和非入药价值局部的物理化学工业标记图片物，为中药才茶的产品掌控提拱措施。
产品質量掌控：经过消化吸收组学能力，行对药材的产品質量采取论述评估和掌控。列举，回收利用藤本绿色植物消化吸收组学论述，行规划设计造成类风湿病性髋肩周炎的药材材料的产品質量标示的催化发光法的方法。除此之外，消化吸收组学还行辨识系统药材中的毒副作用材料试述毒副作用规则，如经过UPLC-Q-TOF-MS论述，差别不一乌头藤本绿色植物的催化材料，并辨识系统含有镇疼特异性和发生急性毒副作用的生物制品碱。
2. 中药药效机制研究
角色靶点判断：分解代谢组学技艺可帮忙判断中草药催化活性化学成分的分子结构靶点。随后，研究探讨表明雷公藤红素可能够调接Treg/TH1和Treg/Th17均衡、阻绝NF-κB径路等策略充分发挥抗感染角色。
效果管理工作机制化诠释：产生转化组学技术水平也能阐明中要材的治疗疾患的效果管理工作机制化。如，论述会发现青蒿素耐药肺结核与疟原虫的线粒体产生转化改进有关，非靶向疗法产生转化组学阐明了与该过程中 相应的的产生转化物变动。显然，产生转化组学还能否可以通过讲解产生转化物的变动，论述中要材复方的效果管理工作机制化。
3. 中药安全性评价
致癌性体系探讨：细胞分解组学技木不错使用于探讨中成药的致癌性体系。随后，使用细胞分解组学和16S rDNA测序的数据整合分析一下，阐述了清益汤对危重症慢性胰腺炎关联慢性肺挫伤的确保体系，并知道了铁镇定自若、差异化细胞分解物和细菌技术菌群范围内的问题。
安会性评价指标：排泄组学技艺还能够 采用草药的安会性评价指标，辨别的内在的的渗透性材料和渗透性靶点，然而为草药的安会食用出示合理合理性。
4. 中医证候研究
证候一些细胞排泄物进行分析：细胞排泄组学技巧还可以广泛用于定性分析与国医理论证候一些的内源性细胞排泄物转化，辅助器国医理论证候的的诊断和应对。举例子，采用细胞排泄组学调查，已在冠相思病朋友中评定出与痰瘀证主气阴两虚证一些的生物制品标志logo物。
证候应对科研探讨：新陈新陈代谢组学新系统还行使主要用于科研探讨中要对老中医证候的应对目的。如，并能新陈新陈代谢组学新系统及聚类算法分折法，遇到“黄芪-茯苓-泽泻”等绑定用量标准配置适使主要用于肾病一体化评估征的新组方用量，并能对多种不同肾病一体化评估征想关的生物体因素物诞生关系。
5. 多组学技术整合应用
几组学数据优化组合：分解代谢组学与别的组学技术设备（如DNA组学、转录组学、淀粉酶质组学等）的数据优化组合APP，为成药实验展示 半个个多空间维度的分析一下框架的。这般数据优化组合APP并不是加强了让我们对成药的成分在氧分子基本特征上对体内生活和病症方式的不良影响，所以为体现成药的角色长效机制和疗效物基本知识展示 了强强大的机器。
常见慢性病疗法方法机理化：几组学技术性也可以用作探索中葯疗法方法常见慢性病的氧分子机理化。这类，按照淀粉酶质组学和基础新陈代谢组学的联办应该用，蕴含了与中医药归类的膝软骨骨性软骨炎关系密切有关的的差别形容淀粉酶和基础新陈代谢信号通路。
基础代谢组学技木在草药的研究中的用，为草药的如今化和准确医疗器械出具了比较重要的有效可以支持，有助于、促使草药的条件化和新多元化进展。