
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT蛋白酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探讨最终结果
设计工人实验设计不断地速冻时光不断延长鸡肉的强度、持来说水力、光色、悬浮子铁含铁、ROS、脂质过空气化合物、MDA、GSH和GPX4层次来测试脂肪组织开展細胞的铁去世睡眠状态。最终结果凸显,速冻时光不断延长后,鸡肉的强度在第3天和第6天更为明显变低;持水工作能力降底;字体颜色变深,有了光泽感,鲜紫色换为暗紫色。前者,悬浮子铁、活力性氧和MDA的含铁更为明显延长,細胞凋亡率更为明显上升。 设计人工提炼其他的冷冻时光的肌肤合格品的球球血清,随后去SDS-PAGE了解,球球血清条带在其他的年间布置一致且类似于(图1a)。选择球球血清在其他的合格品中的表达方式具体情况,了解察觉同一条时间组合格品的中六位数表示于同一条时间层次(图1b),就说明肌肤合格品球球血清享有积极的组内类似于性和组间相互影响性。 球高血清组学共检验费费出1996种球高血清。以B0为比对组,选择B1、B2、B4和B6中的球血清开展不一致性表现介绍,共检验费费到375个DEPs。将火山图可视化管理,并按照其FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05这两个规范标准介绍DEP。结论如图甲随时1c-f随时,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别检验费费出22、33、73和140个DEPs,在这当中分头别上涨6、11、32和83个,变动16、22、41和55个。聚类分析法工艺评估报告格式了各个冷藏箱周期全身肌进行中球高血清的表现,结论信息显示全身肌球血清表现不一致性随会自动储存周期的加剧而加剧(图1g)。
图1| 不一保温的时间的手臂肌肉图纸核脂肪酸组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不同的冰箱的时间的脂肪试样性别差异球蛋白剖析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身亡蛋白质肽的PRM参考值进行分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 依托于KEGG聚集之间的关系表达方式球蛋白的铁生亡规则(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱菌物提供了TMT参考值核核蛋白质含量组学系统设备保障质量,拜谱怪物已类产品研发达成并确立了完美旺盛期的转录组学、核核蛋白组学、代谢转化组学相应两组学联动类产品系统设备保障质量体系中,欢迎致电咨询!
借鉴文献资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.